Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR6

Prep, Prolyl endopeptidase, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrepQ9QUR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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PrepQ9QUR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrepQ9QUR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PrepQ9QUR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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PrepQ9QUR6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PrepQ9QUR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrepQ9QUR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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PrepQ9QUR6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrepQ9QUR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrepQ9QUR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.7 ms