Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tlr4Q9QUK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr4Q9QUK6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr4Q9QUK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms