Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP35Q9P2H5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
USP35Q9P2H5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP35Q9P2H5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP35Q9P2H5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
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