Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH4Q9P2E8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms