Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMOD4Q9NZQ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD4Q9NZQ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD4Q9NZQ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD4Q9NZQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms