Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SACSQ9NZJ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SACSQ9NZJ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SACSQ9NZJ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SACSQ9NZJ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SACSQ9NZJ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms