Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPG21Q9NZD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPG21Q9NZD8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPG21Q9NZD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms