Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CDK12Q9NYV4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CDK12Q9NYV4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CDK12Q9NYV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CDK12Q9NYV4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms