Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMOD3Q9NYL9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMOD3Q9NYL9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TMOD3Q9NYL9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMOD3Q9NYL9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
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