Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBA8Q9NY65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA8Q9NY65 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA8Q9NY65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA8Q9NY65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms