Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHCHD3Q9NX63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHCHD3Q9NX63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHCHD3Q9NX63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms