Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD8Q9NX08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD8Q9NX08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COMMD8Q9NX08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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