Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TCP11L1Q9NUJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCP11L1Q9NUJ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TCP11L1Q9NUJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCP11L1Q9NUJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms