Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMSN1Q9NSI8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SAMSN1Q9NSI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SAMSN1Q9NSI8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SAMSN1Q9NSI8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms