Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOMER2Q9NSB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOMER2Q9NSB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOMER2Q9NSB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HOMER2Q9NSB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms