Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFCQ9NRA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFCQ9NRA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFCQ9NRA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms