Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPNPEP3Q9NQH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XPNPEP3Q9NQH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XPNPEP3Q9NQH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPNPEP3Q9NQH7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms