Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN4Q9NQC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN4Q9NQC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN4Q9NQC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN4Q9NQC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms