Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMMDC1Q9NPL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMMDC1Q9NPL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms