Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SLCO1B3Q9NPD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms