Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A20Q9NP91 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A20Q9NP91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A20Q9NP91 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms