Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSU72Q9NP77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSU72Q9NP77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSU72Q9NP77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms