Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCX3AQ9NNX9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCX3AQ9NNX9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms