Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2bQ9JME9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2bQ9JME9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2bQ9JME9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146 ms