Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sfmbt1Q9JMD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sfmbt1Q9JMD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms