Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnkpQ9JLV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnkpQ9JLV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PnkpQ9JLV6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PnkpQ9JLV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms