Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1aQ9JLR9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd1aQ9JLR9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1aQ9JLR9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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