Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod4Q9JLH8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod4Q9JLH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmod4Q9JLH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmod4Q9JLH8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmod4Q9JLH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms