Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms