Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssna1Q9JJ94 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssna1Q9JJ94 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssna1Q9JJ94 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms