Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpf2Q9JJ80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpf2Q9JJ80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpf2Q9JJ80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpf2Q9JJ80 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms