Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc22Q9JIG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc22Q9JIG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc22Q9JIG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc22Q9JIG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms