Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIE3

Otor, Otoraplin, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtorQ9JIE3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtorQ9JIE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OtorQ9JIE3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtorQ9JIE3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OtorQ9JIE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms