Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2ird1Q9JI57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2ird1Q9JI57 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms