Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L4AQ9HCS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPB41L4AQ9HCS5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EPB41L4AQ9HCS5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPB41L4AQ9HCS5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L4AQ9HCS5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms