Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIAA1549Q9HCM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIAA1549Q9HCM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIAA1549Q9HCM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms