Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSS3Q9H6R3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACSS3Q9H6R3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSS3Q9H6R3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms