Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
STN1Q9H668 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STN1Q9H668 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STN1Q9H668 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STN1Q9H668 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms