Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1DQ9H5J8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1DQ9H5J8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms