Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXF3Q9H4D5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NXF3Q9H4D5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NXF3Q9H4D5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NXF3Q9H4D5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NXF3Q9H4D5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms