Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RSPH9Q9H1X1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RSPH9Q9H1X1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RSPH9Q9H1X1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms