Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1EQ9GZS1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1EQ9GZS1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1EQ9GZS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1EQ9GZS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms