Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aff4Q9ESC8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aff4Q9ESC8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Aff4Q9ESC8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Aff4Q9ESC8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Aff4Q9ESC8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Aff4Q9ESC8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Aff4Q9ESC8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Aff4Q9ESC8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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Aff4Q9ESC8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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Aff4Q9ESC8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Aff4Q9ESC8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Aff4Q9ESC8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aff4Q9ESC8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aff4Q9ESC8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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