Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Irx6Q9ER75 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx6Q9ER75 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx6Q9ER75 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx6Q9ER75 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms