Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx12Q9ER00 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx12Q9ER00 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx12Q9ER00 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx12Q9ER00 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx12Q9ER00 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms