Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rapgef4Q9EQZ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rapgef4Q9EQZ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms