Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a1Q9EPE9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a1Q9EPE9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp13a1Q9EPE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a1Q9EPE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms