Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serpina1fQ9DCQ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Serpina1fQ9DCQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Serpina1fQ9DCQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serpina1fQ9DCQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms