Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MNCb-2875Q9DCB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MNCb-2875Q9DCB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MNCb-2875Q9DCB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms