Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhobtb1Q9DAK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms